Pueblo Hondo tienen sus orígenes en la época precolombina, allí en aquel hermoso valle las parcialidades indígenas de los Manaquenas, los Morotutos, los Yequines y los Timotes tenían establecido un pueblo. En septiembre de 1558 Andrés de Pernía, uno de los expedicionarios de Juan Rodríguez Suárez, descubrió los pueblos que están en la otra banda de la quebrada que corre del páramo que está a las espaldas de Pueblo Hondo. Después de la muerte del capitán Pedro Velasco Sosa quien tomó la primera gente en repartimiento en el año 1577, un año mas tarde de la fundación de la Grita, y como reconocimiento a sus acciones, el capitán Francisco de Cáceres le adjudicó parte de esas tierras y términos a sus descendientes y herederos. En el año 1657, se compusieron o contrataron las tierras a favor del cabildo de la ciudad Espíritu Santo de la Grita y vendió a sus vecinos con títulos parte de Pueblo Hondo, entre ellos a Juan Bautista Osorio y sus hermanos Catalina y Martín, ocho estancias; al Capitán Martín Osorio Rujano, cuatro estancias en el Valle, cinco en Sabana Grande, cuatro en el paso del Páramo de la Negra; al Padre Bartolomé Carrero de Escalante, una estancia y dieciséis en el Páramo de Mariño; al Capitán Alonso de Contreras, ocho estancias en el mismo Páramo. Cuando fue alcalde de La Grita, el Capitán Alonso de Contreras poseyó en encomienda a los indios de Pueblo Hondo, la misma constaba de seis indios tributarios y se la otorgó el gobernador de Mérida y antes había sido de Francisco Gómez Pabón. En 1681, siendo guardián del Convento de San Francisco o Santa Clara de La Grita el Padre Fray Benítez, se perdieron las doctrinas de Pueblo Hondo y Venegara, y pasaron a Santa Fe de Bogotá. Al dividir a La Grita en dos parroquias en 1835, correspondió a la Iglesia Matriz o del Espíritu Santo las aldeas de Guanare, Venegara, Los Naranjos, Sabana Grande, Pueblo Hondo, Llano del Cura, Santo Domingo, Las Mesitas, Seboruco y Omuquena. El 16 de noviembre de 1839, se informó al Obispo de la Diócesis sobre la necesidad que había de establecer oratorios e iglesias en Seboruco y Pueblo Hondo, en razón de la distancia. En 1852, el Consejo Municipal envió una relación en donde hizo constar que Yeguines, San Simón, no debe apartarse de su Ciudad Cabecera, La Grita, para unirse a Zea, porque ésta no tenía la población suficiente para ser municipio. En 1861, se divide políticamente el Cantón de La Grita en parroquias, barrios, partidos y aldeas. La Grita, San Pedro de Seboruco, Vargas, El Cobre, Queniquea, Pregonero, Omuquena, Pueblo Hondo, Yeguines y San Antonio de Caparo. La Grita en Barrios o Partidas, El Surural, Aguadías, Agua Caliente, Quebrada de San José, Alto de los Duque, El Valle, Santo Domingo, Venegara, Sabana Grande y Guanare. El 5 de mayo de 1869, los vecinos de Pueblo Hondo solicitan el derecho personal subsidiando de ese vecindario y el de Yeguines para la construcción de su iglesia; los trabajos de la construcción duraron hasta 1873. El 17 de diciembre de 1882, fundación real de Pueblo Hondo, por solicitud de los vecinos de la aldea, piden a la Corporación Municipal se demarque o delinee las calles, carreteras, plaza y demás sitios o casas de gobierno. En ese mismo año se sucedió un hecho insólito, el nuevo Obispo Román Lovera decidió segregar eclesiásticamente a Yeguines, San Simón y Pueblo Hondo de la jurisdicción de La Grita y anexarlos a Zea de la sección Guzmán Blanco (Mérida), lo que levantó una protesta general en La Grita y en los pueblos afectados; en acto fechado en 1883, los habitantes de Pueblo Hondo pidieron se reconsiderara la decisión y firmaron: Ezequiel Ramírez, Julián Contreras, Rosendo Mora, Eustaquio Arellano, José del Carmen Arellano, Juan M. Carrero y otros. El Obispo estudió el caso y reconsideró. Yeguines y Pueblo Hondo volvieron a su jurisdicción natural. En ordenanza del Consejo Municipal de La Grita, el 3 de mayo de 1883, se le dieron los límites a San Simón o Yeguines y a Pueblo Hondo. La Asamblea Constituyente del Estado Soberano del Táchira en 1866, dictó un decreto en el cual nombra a Pueblo Hondo como Distrito del departamento La Grita: "La Asamblea Constituyente del estado Soberano del Táchira. Considerando: Que está completamente demostrado que es necesario, útil y conveniente instituir en Distrito los caseríos: Pueblo Hondo, Yeguines y Escalante en el Departamento La Grita, constantes de más de mil almas, Decreta: Art. 1º: Se erige en Distrito Civil los siguientes caseríos: Pueblo Hondo, Yeguines y Escalante. Art. 2º: Se fijan los límites a dicho Distrito los siguientes: el Portachuelo del Palmar, línea recta al páramo San Telmo por el sur; por el norte línea recta al rincón del Oso, puesta la cumbre límite con Bailadores y la Parroquia Zea. Art. 3º: El Presidente del Estado elegirá por ahora los empleados que deben regir los destinos del nuevo Distrito de Pueblo Hondo, siendo éste la cabecera del Distrito. Dado en el salón de Sesiones Constituyente del Estado Soberano del Táchira, en San Cristóbal a 5 de marzo de 1866, 3º de la Ley y 8º de la Federación. El Presidente Ignacio D' Caicedo, el Diputado Secretario Rafael J. Castillo, Poder Ejecutivo del Estado Soberano del Táchira. San Cristóbal, 5 de marzo de 1866. Ejecútese. José de Jesús Entrena por el ciudadano Presidente, el Secretario de Gobierno Octavio Catel"
